新葡的京集团网址视野丨从个人基因组图谱优化药物预测

【摘要】
癌症患者往往表现出异质性药物反应，因此只有一小部分患者对特定抗癌药物敏感。随着通过下一代测序进行大规模基因组分析的可用性，现在对单个患者的整个转录组和基因组进行分析以确定其独特的基因突变和差异表达基因在经济上是可行的，这些基因被认为是导致异质性药物反应的原因。虽然亚型分析已经确定了具有共同生物标志物的患者亚组，但没有有效的方法精确可靠地预测个体患者的药物反应。在此，我们提出了一种新的计算算法，根据个人基因组图谱以及药物基因组学和药物敏感性数据预测个体患者的药物反应。具体而言，从癌症数据库中的药物敏感性基因组学中获得了50多种癌症的600多个癌症细胞系（视为个体患者）及其对75种药物的反应。药物特异性敏感性特征是通过单个细胞系对特定药物的反应的基因组图谱变化来确定的。通过整合来自其他细胞系的投票，预测了单个细胞系的最佳药物。实验结果表明，所提出的药物预测算法可以大大提高为个体患者寻找最佳药物的可靠性，从而成为肿瘤治疗精确医学基础设施的关键组成部分。

 

 

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